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試してはいませんが、こちらのサイトの情報によれば、ビルドサイズ削減につながるとのことですのでアップロード容量もその分、削減されると思います。

ただし頂点が減るとか、表示負荷が減るといった話ではないように思います。

https://docs.unity3d.com/ja/current/Manual/mesh-compression.html

https://light11.hatenadiary.com/entry/2018/03/27/222603

LowまたはMediumあたりが良いようにも思います。

https://unitygeek.hatenablog.com/entry/2016/09/15/151120

ただ、マニュアルによれば、Mesh Compressionの有効化は、Vertex Compression の無効化にもつながるようなので、必ず削減につながるかどうかは試していただくほかないかもしれません。

アップロード容量（あるいはアップロードの時間）が気になる場合は、不要なファイルを除外した、アップロード専用のプロジェクトを作成されると良いかとは思います。